Zentrale Forschungseinheiten

RCF1: Biobank und Histopathologie

Koordinator: Prof. Dr. K.W. Schmid

In der zentralen Biobank werden Tumormaterial (schock-gefroren und in Paraffin eingebettet), Serum, Urin, Liquor, DNA- und RNA-Proben von Krebspatienten gelagert und gemeinsam mit den entsprechenden anonymisierten klinischen Daten für Forschungsprojekte bereitgestellt. Durch die Einbeziehung von Patientenmaterial wird die klinische Relevanz unserer Forschungsergebnisse sichergestellt.

Die histopathologische Analyse von Tumormaterial einschließlich immunhistochemischer Färbungen gehört einerseits zur etablierten Routinediagnostik, andererseits können zusätzliche Spezialuntersuchungen
im Rahmen von Forschungsprojekten durchgeführt werden.

RCF2: Epidemiologie, Biostatistik und klinisches Tumorregister

Koordinator: Prof. Dr. K.-H. Jöckel


Epidemiologie

Neben analytisch-epidemiologischen Studien (Fall-Kontroll-Studien, Querschnittsstudien, Kohortenstudien) werden deskriptiv-epidemiologische Studien, insbesondere zeitliche Trendanalysen von Krebsinzidenzen und Zeitreihenanalysen durchgeführt. Ein Schwerpunkt ist die Untersuchung von Risikofaktoren für Krebserkrankunken unter Berücksichtigung von Arbeitsplatz- und Umweltexpositionen sowie Lebensstilfaktoren. Prof. Jöckel ist Principal Investigator (PI) der Heinz Nixdorf Recall-Studie, einer prospektiven bevölkerungsbasierten Kohortenstudie im Ruhrgebiet (n = 4814), die u. a. Krebsmorbidität und -mortalität als Endpunkte untersucht.
 

Biostatistik

Die statistische Planung, Koordination und Auswertung von nationalen und internationalen klinischen und epidemiologischen Studien gehören neben der Weiterentwicklung von statistischen Methoden zu den Schwerpunkten im Bereich der Biometrie. Außerdem werden Studien zur genetischen Disposition und experimentelle Grundlagenforschung bei Krebserkrankungen unterstützt. Im Bereich Bioinformatik werden anfallende Forschungsdaten im Kontext mit klinischen Parametern analysiert. Neue Technologien im Bereich der Molekularbiologie erzeugen gewaltige Datenmengen. Zum Beispiel ermöglicht es die DNA-Chip-Technologie, die Expression von mehreren tausend Genen simultan zu analysieren. Die dabei gewonnenen Informationen werden mittels informationstechnischer Methoden verwaltet und durch statistische Verfahren ausgewertet.
 

Klinisches Tumorregister

Seit Realisierung der halbautomatischen Datenübernahme aus dem Patienteninformationssystem werden täglich Daten in die Datenbank des Klinischen Tumorregisters importiert. Neben den Tumoren werden Patientenstammdaten, Kontaktdaten sowie weitere Diagnose- und Prozedurdaten gespeichert, mit dem Ziel weitere tumorspezifische Angaben zu allen registrierten Tumoren zu erfassen. Die Daten werden an das epidemiologische Krebsregister NRW (EKR-NRW) gemeldet. Hauptzweck dieser Studien ist das Unterlegen diagnostischer und ätiologischer Fragestellungen, für die eine große Zahl von Fällen benötigt wird.

RCF3: Microarrays / BioChip Labor

Koordinator: PD Dr. L. Klein-Hitpass

Im Jahr 2000 wurde am Institut für Zellbiologie ein Spezial-Labor mit einem Affymetrix-System zur Messung von DNA-Microarrays, auch BioChips genannt, eingerichtet. Das BioChip Labor ermöglicht die Analyse aller aktuellen Affymetrix Arraytypen (Expressions-, Genotypisierungs- Resequenzierungs- und Tiling-Arrays). Die Expressionsarrays erlauben es beispielsweise, die transkriptionelle Zellaktivität aller Gene in normalen und Tumor-Zellpopulationen zu bestimmen und zu vergleichen. So werden neue Einblicke in onkologische Genregulations- und Entwicklungsprozesse ermöglicht, die zu einem besseren Verständnis der Krankheitsvorgänge führen. Neben Expressionsarrays gewinnen sogenannte SNP-Arrays zu Genotypisierung an Bedeutung. Genotypisierungsdaten werden zunehmend zur Analyse chromosomaler Aberrationen in Tumoren eingesetzt. Das BioChip Labor steht allen Arbeitsgruppen am WTZ zur Verfügung.

RCF4: Pharmakogenetik

Koordinator: Prof. Dr. W. Siffert

Die Pharmakogenetik erforscht Genvarianten, die das Ansprechen auf Arzneimittel oder auf andere medizinische Therapieformen beeinflussen. Solche Veränderungen können im Bereich von Transportproteinen, bei Stoffwechselwegen oder in pharmakologischen Zielstrukturen auftreten.

Manche Medikamente verursachen schwerwiegende Nebenwirkungen. Durch Genuntersuchungen lassen sich Risikopatienten frühzeitig identifizieren. Daneben erforscht diese Einheit auch Genveränderungen, die das Entstehen und den Verlauf von Krebserkrankungen mitbestimmen.

RCF5: Zentraler Sequenzierservice

Koordinator: Prof. Dr. D. Lohmann

In dieser Einheit werden zentral Aufträge zur DNA-Sequenzierung durchgeführt. Proben können von montags bis donnerstags in der Zeit von 10:30 Uhr bis 11:30 Uhr im Institut für Humangenetik abgegeben werden.

RCF6: Proteomics

Koordinator: Prof. Dr. A. W. Rettenmeier  Functional proteomics technologies provide the means to define and compare protein profiles in normal and pathological samples, correlate protein profiles with biological activities, define disease mechanisms at a molecular level, establish inter-relationships among proteins, identify temporal patterns of expression and define the function of uncharacterized proteins. As a result, there is intense interest in applying proteomics to foster a better understanding of cancer processes. One area of intense interest includes biomarker identification for diagnosis, early detection, prediction and prognosis of cancer. Additionally, many translational approaches attempt to indentify tumor antigens recognized by the immune system, discover new molecular targets for accelerated drug development and identify markers to measure therapeutic efficacy, toxicity and patient stratification during clinical trials and patient treatment.

The mission of RCF6 is to develop a comprehensive and interdisciplinary proteomics core for high sensitivity, high resolution and high throughput proteomics with particular emphasis on clinical sample analysis. RCF6 will combine consultation, service and education into a comprehensive, translationally and clinically oriented proteomics core. The core is already well equipped with broad array of state-of-the-art analytical instrumentation for proteomic studies, which include a MALDI-TOF mass spectrometer, a ProteinChip Reader (SELDI-MS), a MALDI spotter, and equipment for the electrophoretic and chromatographic separation of proteins. The instrumentation will be operated by the highly trained technical staff of the core laboratory. The core has already developed standard procedures for QC to assure the timely delivery of accurate and high quality data. Finally, a consultative service provided by key members of the core will be available to assess the rationale and feasibility for undertaking specific projects, designing proteomics studies, process and protocol development, proteomic data analysis, and interpretation of results.

RCF7: Transgene Mausmodelle

Koordinator: PD Dr. G. Hilken

In dieser Einheit des zentralen Tierlaboratoriums werden die transgenen Mausmodelle für das WTZ vorgehalten.

The mouse provides an excellent mammalian model system to study the genetic, molecular, and cellular mechanisms of cancer. Advances in microinjection techniques for the introduction of foreign DNA into the mouse germ line as well as in the engineering of embryonic stern cells for injection into the mouse blastocyst had yielded two powerful experimental tools: gene overexpression or suppression in specific tissues of the mouse (transgenic mice) and ablation of specific gene expression in the entire mouse or in tissue-specific manner (knock-out mice). These technologies have been used to explore the role of a variety of genes during development and during the development of disease. The mouse core facility at the WTZ currently provides centralized, expert service to successfully produce these animal models as powerful tools for in vivo studies of cancer causation and pathogenesis for the WTZ investigators. In addition, the facility will complement its services through acquisition of state-of-the-art techniques in mouse cryobiology. From generation of genetically modified mice, over clean-up of genetic background and hygiene, to safe storage of germ plasm, many services related to mouse models will soon be available.

RCF8: Funktionelle Immunphänotypisierung

Koordinator: Prof. Dr. J. Buer

In the new Robert-Koch-Haus at the University Hospital of Essen we are currently establishing a platform for functional immune phenotyping. This platform will be intensively used by physicians and scientists interested in characterizing and modulating the immune system in the course of cancer in patients and complex animal models. This works makes use of platforms for flow cytrometry (Multi-color analysis and AutoMACS Technology) to isolate specific cell populations from in vitro and in vivo experiments, protocols for the amplification of RNA from low abundant cell populations. Affymetrix microarrays, real-time PCR (TaqMan) and single-cell RT-PCR methods.

In addition, immune responses will also be characterized by state-of-the-art. Multimetrix Technology (Luminex Technology). This topic will also provide strategies and tools to modulate human and murine T cell immune responses (Retroviral/Lentiviral overexpression/RNAi Technology) to break down tolerance towards tumors. Training will be provided to the partners of the initiative and their clinical partners to study human immune cells at the molecular and functional level.

RCF9: Zentrum für klinische Studien Essen (ZKSE)

Koordinator: Prof. Dr. K.-H. Jöckel

Aufgabe des ZKSE ist die Unterstützung aller Aspekte klinischer meist multizentrischer Studien unter Berücksichtigung wissenschaftlicher Kriterien, Good Clinical Practice (GCP) sowie allen geltenden gesetzlichen Bestimmungen und Leitlinien. Dies betrifft sowohl zulassungsrelevante Studien als auch wissenschaftsgesteuerte Studien, sogenannte Investigator-initiated trials (IITs).

Im Einzelnen gehören dazu:

Studienplanung / -vorbereitung
1. Organisatorische und logistische Studienplanung bzw. ?vorbereitung
2. Biometrie / Epidemiologie
3. Datenmanagement

Studiendurchführung / -auswertung
1. Biometrie: Statistische Analyse und Berichte
2. Datenmanagement
3. Monitoring
4. Projektmanagement und Logistik

Zu den Aufgaben des KKS gehört weiterhin die Fortbildung von Studienpersonal (z. B. Studienassistenten, Prüfärzte, Studienleiter) sowie die Organisation und Durchführung von Fortbildungsveranstaltungen zu aktuellen Themen klinischer Studien.

Darüber hinaus stellt das ZKSE methodisches Know-how auf Anfrage zur Verfügung.

RCF10: Klinisches Studienzentrum Onkologie

Koordinator: Prof. Dr. K.-H. Jöckel

Das Klinische Studienzentrum Onkologie stellt die Onkologie-spezifische Untereinheit des ZKSE dar. Hier werden alle klinischen Studienaktivitäten des WTZ koordiniert. Das im ZKSE geschulte Studienpersonal wird den einzelnen WTZ-Kliniken zur Studiendokumentation vor Ort zur Verfügung gestellt.

RCF11: Phase-I-Einheit und analytische Pharmakologie

Koordinator: Prof. Dr. M. Scheulen

Die Phase-I-Einheit ist eine selbständige Untereinheit des ZKSE undkoordiniert sämtliche Studien der frühen klinischen Entwicklung (Erstanwendung am Menschen, Proof-of-Concept-Studien) für das Indikationsgebiet Onkologie. Ebenso werden hier die begleitenden Pharmakokinetik- und Pharmakodynamik-Studien durchgeführt.

Ihre Ansprechpartner

Wissenschaftlicher Leiter: Prof. Dr. K.-H. Jöckel
Stellvertreterin: Dr. Tanja Trarbach
Geschäftsführerin: Claudia Ose
Stellvertreterin: Hildegard Lax
Kaufmännische Geschäftsführerin:Dr. Claudia Pieper

E-Mail: vorname.nachname@uk-essen.de   

Vorwahl: +49(0)201-723 ....

Sekretariat
Banu Demirci
-4514-

Studienplanung
Claudia Ose
-4519-

Organisatorisches
Hildegard Lax
-4522-

Biometrie
Dr. Andre Scherag
-4793-

Klinische Epidemiologie
Dr. Barbara Hoffmann
-4463-

Monitoring
Anja Merkel-Jens
-4798-

Data Management
Dorothea Weiland, M. A.
-4461-

Schulung
Anja Marr
-4134-

Finanzen
Dr. Claudia Pieper
-4504-

Weitere Informationen:

www.imibe.eu

www.zkse.de